Billede: NIH NIAID/Flickr
Celler, de er alle forskellige. Endda to, der ligner hinanden, de celler, der skal arbejde sammen i det samme væv kan udtrykke helt forskellige egenskaber, og lave forskellige proteiner. Så hvordan gør du venstre og højre for det hele?
At være i stand til hurtigt at klassificere masser af celler hurtigt og effektivt har været en vanskelig opgave, og tidligere metoder har krævet, der kigger på én celle ad gangen, efter at en University of Washington pressemeddelelse. Men et team af UW forskere har udviklet en metode til hurtigt og billigt at bestemme subtile forskelle mellem de forskellige typer af celler i en organisme. De har kun testet det på orm, men det kan en dag blive brugt til større ting.
Forskerne tror, for eksempel, at forskerne kan bruge deres metode til at skabe et atlas “til at definere den molekylære tilstand af hver celle i hele livscyklussen af C. elegans,” som de skriver i avisen, der er offentliggjort i dag i tidsskriftet Science. Men, med skalering, andre organismer—som mennesker—kan komme næste. At forstå alle de celletyper, som kan hjælpe forskerne en bedre forståelse af den menneskelige udvikling ned til det mest grundlæggende niveau, hvordan celler differentiere og hvordan denne differentiering ændringer over tid. Vigtigere, det kunne også hjælpe forskerne med at forstå, hvorfor denne proces nogle gange går galt, og hvordan vi kan være i stand til at ordne det.
Hver celle har en transkriptom, eller sin egen liste over særlige messenger genetiske materiale, som er kendt som mRNA. Jobbet af mRNA, er at læse DNA, skal du oprette en kopi af vejledningen, og medbringe kopi til protein fabrik. Hvis DNA er en rulle film, så transkriptom er summen af alle de negativer (mRNA) til fotos cellen rent faktisk ønsker.
Den nye metode kaldes sci-RNA-seq. Forskerne sætter celler ind i en lille, rektangulær matrix af rum, hver med særlige tags, der lægger til RNA. Efter et par gentagelser af processen, hver celle producerer et unikt sæt af tags som forskerne kan bruge til at skelne dem fra hinanden.
Når forskerne følte, at de kunne trygt slags menneskelige celler og mus, flyttede de over på den populære C. elegans orm, som har mindre celler og mindre mRNA end mennesker. Efter sekventering omkring et tusind celler, fandt de 27 celletyper, og kunne bore ned til endnu finere niveauer af klassifikationer, baseret på, hvad mRNA var at gøre. De fandt 40 kategorier af hjerneceller, for eksempel.
Selve metoden, som i dag, kun sekvenser omkring 40.000 celler samtidig. Men forskerne håber, at en dag at flytte til “mere end 10 millioner celler pr eksperiment,” og måske en dag kunne gøre en enorm atlas of the bounty af menneskelige celler.
En forsker ikke involveret i undersøgelsen, David M. Miller fra Vanderbilt University, fortalte NY Times, at den nye metode vil kunne fremskynde processen og sænke omkostningerne betydeligt. Men der er begrænsninger, og en masse af det resterende arbejde. Som New York Times rapporterer, at de forskere, der ikke kunne finde nogle af de tidligere dokumenteret C. elegans hjerne celle typer. Og naturligvis, med deres 37 billioner celler, mennesker er helt sikkert en større udfordring, end en dinky orm.
Så vidt bragworthy tomes til dit personlige bibliotek, en encyklopædi af alle de menneskelige celler ville helt sikkert tage titlen “bedste”. Eller helt sikkert, uh, den mest specifikke.
[Videnskab]