Afbeelding: NIH NIAID/Flickr
Cellen, ze zijn allemaal anders. Zelfs twee vergelijkbare cellen die verondersteld worden samen te werken in hetzelfde weefsel mogelijk express geheel verschillende eigenschappen en verschillende eiwitten. Hoe maak je links en rechts van dit alles?
In staat om snel te classificeren veel cellen snel en efficiënt is een moeilijke taak, en de vorige methoden zijn vereist op zoek naar een cel in een tijd, volgens een van de University of Washington press release. Maar een team van OW onderzoekers hebben bedacht een methode om snel en goedkoop te bepalen subtiele verschillen tussen de verschillende soorten cellen in een organisme. Ze hebben alleen getest op wormen, maar het zou een dag worden gebruikt voor de grotere dingen.
De onderzoekers denken bijvoorbeeld dat wetenschappers hun methode voor het creëren van een atlas voor het definiëren van de moleculaire toestand van elke cel gedurende de levensduur van C. elegans,” schrijven ze in de krant dat vandaag wordt gepubliceerd in het tijdschrift Science. Maar, met schalen, andere organismen—zoals de mens—zou de volgende komen. Inzicht in alle celtypen kan onderzoekers helpen beter te begrijpen de menselijke ontwikkeling op haar meest fundamentele niveau, hoe de cellen differentiëren en hoe die differentiatie in de tijd verandert. Nog belangrijker, het kan ook helpen wetenschappers begrijpen waarom dit proces soms gaat het fout, en hoe kunnen we misschien in staat om het te repareren.
Elke cel heeft een transcriptoom, of zijn eigen lijst van speciale boodschapper genetische materiaal dat bekend staat als mRNA. De taak van het mRNA is om te lezen het DNA, het creëren van een kopie van de instructies, en brengen de kopie naar de eiwit fabriek. Als het DNA een rol van film, dan is het transcriptoom is de som van alle negatieven (mRNA) voor de foto ‘ s van de cel eigenlijk wil.
De nieuwe methode heet sci-RNA-seq. De onderzoekers zetten de cellen in een kleine, rechthoekige matrix van compartimenten, elk met speciale tags die hechten aan het RNA. Na een paar iteraties van het proces, elke cel produceert een unieke set van tags die de onderzoekers kunnen gebruiken om ze uit elkaar te houden.
Zodra de onderzoekers vonden dat ze konden vertrouwen soort mens en muis cellen zijn, zijn ze verhuisd naar de populaire C. elegans worm, die kleinere cellen en minder mRNA dan de mens. Na sequencing ongeveer duizend cellen, ze vond 27 soorten cellen, en kan een niveau om nog fijnere niveaus van classificaties, waarnaar wordt, op basis van wat het mRNA aan het doen was. Ze vond 40 categorieën van hersencellen, bijvoorbeeld.
De methode zelf, op de dag van vandaag, alleen sequenties ongeveer 40.000 cellen tegelijk. Maar de onderzoekers hopen om op een dag te verplaatsen naar “meer dan 10 miljoen cellen per experiment,” en misschien, op een dag zou een enorme atlas van de bounty van menselijke cellen.
Een onderzoeker niet betrokken bij de studie, David M. Molenaar van de Vanderbilt Universiteit, vertelde de new york Times dat de nieuwe methode kan het proces versnellen en de kosten te verminderen aanzienlijk. Maar er zijn beperkingen en een stuk van de resterende werken. Als de New York Times meldt dat de onderzoekers niet kunnen vinden van een aantal van de eerder gedocumenteerd C. elegans hersenen cel typen. En natuurlijk, met hun 37 biljoen cellen, de mensen zijn zeker een grotere uitdaging dan een dinky worm.
Zo ver als bragworthy boeken voor uw persoonlijke bibliotheek, een encyclopedie van alle menselijke cellen zou zeker de titel van “beste.” Of in ieder geval, uh, meest specifieke.
[Wetenschap]