Les premiers cas de C. auris dans le pays ont été attribués à une seule unité de soins intensifs covid-19 à Salvador, au Brésil.
Un infirmier illustration des champignons Candida aurisIllustration : Stephanie Rossow/CDCÀ la fin de l'année dernière, une levure mortelle connue sous le nom de Candida auris a été trouvée au Brésil pour la première fois. Dans un nouvel article cette semaine, les scientifiques qui ont traité et enquêté sur ces premiers cas affirment que la pandémie de covid-19 a contribué à créer un terrain fertile pour l'émergence et la propagation du champignon à l'intérieur de l'unité de soins intensifs d'un hôpital.
C. auris a été découvert pour la première fois par des médecins japonais en 2009, bien qu'il infecte probablement les gens depuis au moins les années 1990. Ses origines sont encore un mystère, mais la théorie dominante est qu'elle n'a commencé que récemment à causer des problèmes aux humains. Ce qui rend la levure si dangereuse, c'est que les souches sont souvent (ou deviennent rapidement) résistantes à plusieurs médicaments antifongiques. Ses symptômes initiaux ressemblent à ceux de la grippe, mais dans les cas graves, il peut envahir la circulation sanguine et plusieurs organes, entraînant des lésions organiques et/ou une septicémie potentiellement mortelle. Bien que toutes les infections ne rendent pas les gens malades, la résistance robuste de la levure peut rendre les infections graves incroyablement difficiles à traiter et souvent mortelles, en particulier pour les personnes déjà affaiblies dans les hôpitaux ou immunodéprimées. Il est également difficile de décontaminer les environnements où le champignon colonise à l'extérieur du corps, tels que les cathéters ou autres équipements médicaux qui offrent une voie facile à l'infection.
Depuis 2019, les Centers for Disease Control and Prevention ont qualifié C. auris de menace urgente de superbactérie, tandis que les pays et les hôpitaux du monde entier sont en état d'alerte élevé. En décembre 2020, le Brésil est devenu le dernier pays à déclarer l'avoir trouvé. Et lundi, une nouvelle étude a détaillé deux de ces premiers cas, deux patients hospitalisés pour covid-19 dans la même unité de soins intensifs d'un hôpital de la ville de Salvador.
Selon le rapport, publié dans le Journal of Fungi, les cas concernaient un homme de 59 ans et une femme de 72 ans, tous deux hospitalisés pour un syndrome respiratoire aigu sévère de covid-19 en octobre 2020 et novembre 2020 , respectivement. Les deux patients ont subi plusieurs autres infections, dont C. auris. Contrairement aux épidémies passées, cependant, cette souche semblait sensible à de nombreux antifongiques courants. Les deux infections ont été traitées et l'homme a finalement récupéré suffisamment pour être libéré après 49 jours; malheureusement, la femme n'a pas eu cette chance, succombant à ses nombreux maux fin janvier 2021.
Depuis ces premiers cas, les responsables de la santé publique ont documenté neuf autres personnes atteintes de C. auris colonisant leur corps en décembre 2020, qui avaient toutes visité cette même unité de soins intensifs. Les cas semblent remonter à une source locale, aucun des patients n'ayant voyagé récemment et leurs champignons respectifs étant étroitement liés les uns aux autres. À l'heure actuelle, les auteurs spéculent que le champignon pourrait être arrivé ou émergé localement des mois avant le premier cas. Et bien que cette souche semble toujours être traitable avec des médicaments conventionnels, les échantillons isolés de ces patients ont commencé à devenir plus résistants à au moins certains antifongiques au fil du temps.
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D'autres pays ont récemment signalé leurs propres épidémies de C. auris parmi les patients covid-19. Et dans cette épidémie, la maladie grave provoquée par covid-19 et l'hospitalisation qui en a résulté ont probablement permis au champignon colonisateur de devenir mortel et d'infecter d'autres personnes malades, une série d'événements qui pourraient se répéter ailleurs.
“Ainsi, la pandémie de covid-19 pourrait accélérer l'introduction et/ou la propagation de C. auris dans les précédents environnements hospitaliers sans C. auris”, ont écrit les auteurs.
C. auris n'est pas la seule infection fongique liée au covid-19 qui a effrayé les médecins ces derniers temps. Au cours du pic le plus récent et le plus meurtrier de la pandémie en Inde, les cas d'une infection normalement très rare causée par des mucormycètes, appelée champignon noir, ont commencé à augmenter, avec environ 12 000 cas documentés dans le pays au cours des derniers mois. Comme C. auris, cette infection peut s'avérer incroyablement mortelle une fois qu'elle commence à rendre malades les patients hospitalisés, tuant jusqu'à la moitié de ses victimes. Ce n'est pas seulement le covid-19 qui contribue à ces épidémies, mais aussi son traitement principal : les stéroïdes qui atténuent la réponse immunitaire trop agressive mais nous rendent également plus vulnérables aux co-infections par les champignons et autres microbes.
Tous ces cas constituent un rappel pertinent du bilan direct et indirect qu'a eu le covid-19, un bilan qui devrait se poursuivre dans un avenir prévisible dans les pays sans un approvisionnement suffisant de vaccins contre le covid-19 ou d'autres mesures de précaution. Le pic de l'Inde est enfin tombé, mais le Brésil continue de connaître un niveau élevé de nouveaux cas et de décès. Et avec la propagation de variantes plus transmissibles telles que Delta, découverte pour la première fois en Inde, le monde dans son ensemble reste vulnérable à de nouveaux pics de maladie qui entraîneront d'autres cauchemars comme C. auris. À ce jour, seulement environ 15 % de la population mondiale est même partiellement vaccinée.
Les responsables de la santé publique continuent d'enquêter sur la souche spécifique de C. auris trouvée dans ces Cas brésiliens, qui semblent être la première apparition locale d'un sous-type particulier du champignon (Clade I, trouvé pour la première fois en Asie du Sud) documenté en Amérique du Sud. L'espoir est que découvrir comment il est apparu pour la première fois et pourquoi il est un peu différent des souches précédentes pourrait donner aux scientifiques des indices sur la meilleure façon d'arrêter sa propagation.
Ed CaraPostsEmailTwitter
Né et élevé à New York, Ed couvre la santé publique, les maladies et la science animale étrange pour Gizmodo. Il a déjà fait des reportages pour Atlantic, Vice, Pacific Standard et Undark Magazine.