Afbeelding: Guilherme Tavares/Flickr
Ieder jaar gaan we dezelfde bewegingen: de Wetenschappers erachter te komen wat de meest voorkomende griep spanningen zullen worden, en het voorbereiden van een vaccin dat beschermt tegen. Mensen die ingeënt voorkomen dat de nieuwe stammen, degenen die niet kunnen ziek worden. Maar elke zo vaak, een nieuwe vorm van griep opduikt die artsen zijn niet voorbereid te vaccineren tegen. Dat soort griep kan uitgroeien tot een pandemie.
Voorspellen wat de pandemische griep zou kunnen uitzien vereist dieper begrip van het influenza virus. Dit begrip gaat verder dan hoe het wordt overgedragen en naar beneden naar de genetische samenstelling van het virus zelf. Een samenwerking tussen de laboratoria van de Universiteit van Pittsburgh onderzoekers Nara Lee en Seema Lakdawala nam een kijkje op de vorm van dat het virale genoom en vond een onverwachte opstelling van genetisch materiaal, dat zou vereisen sommige leerboek herschrijft, en kan helpen bij het model de volgende pandemie stam.
Het influenza A-virus, in onze vorige begrijpen, had een vrij eenvoudige structuur: acht strengen van genetisch materiaal (de zogenaamde RNA, die eruit ziet als de helft van een DNA-streng, maar is een beetje anders) gewikkeld strak en gelijkmatig rond eiwitten. “In elk leerboek, de architectuur is een mooie panhandle structuur waar de RNA is gewikkeld rond deze kralen,” studie auteur Seema Lakdawala vertelde Gizmodo. “We vinden het niet alleen maar kralen aan een touwtje.”
Het team gebruikt een methode voor het in kaart brengen waar de RNA bindt met eiwitten genaamd HITS-CLIP, (een afkorting voor High-throughput sequencing van RNA geïsoleerd door crosslinking immunoprecipitation), voor de omverwerping van dat leerboek foto. Ze vond dat de virussen zouden hebben lussen van RNA opknoping uit als stukjes van afgewikkeld draad in een trui.
Dit alles klinkt misschien vrij esoterisch, maar het zou kunnen hebben een aantal belangrijke implicaties voor het bestuderen van de griep virus. Zelfs vergelijkbaar stammen van de griep zou hebben van de verschillende regelingen van deze gratis loops, volgens de papieren onlangs gepubliceerd in het tijdschrift Nucleïnezuren Onderzoek. Het bestuderen van deze lussen kunnen helpen wetenschappers om te begrijpen hoe de RNA regelt zichzelf, en hoe virussen het overwinnen van het immuunsysteem aanvallen van hun gastheren. Het zou zelfs helpen wetenschappers een model hoe influenza recombines en schudt genetisch materiaal rond, het maken van onverwachte spanningen die kunnen leiden tot pandemieën.
Er is een hedendaags voorbeeld zou dit al het geluid uit meer echt: 2009 de mexicaanse griep-pandemie. Lakdawala begonnen met het bestuderen van de griep voor de Nationale Instituten van Gezondheid in 2009, toen ze dachten dat het volgende griep-pandemie zou komen van een vogel is niet een varken. Ze vertelde Gizmodo is het mogelijk een stam van het griepvirus van een Europese varkens gemengd met een ander soort uit een Amerikaanse varken, en het genetisch materiaal opnieuw gecombineerd op basis van de influenza virussen ” structuren van ballen, string en loops, het creëren van de pandemie veroorzaakt vorm van de mexicaanse griep. “Dat virus kunnen overbrengen in een persoon, en dat stuurt persoon tot persoon,” zei ze.
Mensen kijken nu naar varkens en vogels te zien waar de volgende stam zou kunnen komen. “Misschien wel, nu doen we een betere baan met bewaking bij het varken,” zei ze, “Maar ik denk dat we kunnen krijgen gevangen off guard met een reassortment,” een schuifelen rond van genetisch materiaal op basis van deze genomische virale structuur.
Vorm en functie zijn nauw met elkaar verbonden als het gaat om zaken als virussen, eiwitten en DNA. Een eenvoudige verandering in het wetenschappelijke begrip van de manier waarop genetische materiaal is geregeld kunt hebben een immense impact op het uitzoeken hoe het werkt. In het geval van de griep, dat inzicht kan misschien zelfs levens redden.
[Nucleic Acids Research]