Tara sejlads i arktis.Foto: Tara Ocean
Efter at have rejst rundt i verden, prøveudtagning havet fra pol til pol, forskerne har afdækket næsten 200.000 bestande af marine virus.
I det marine økosystem, lille levende ting kaldet mikrober udgør størstedelen af havets biodiversitet og over halvdelen af biomassen. Men vi ved meget mindre om virus—pakker af genetiske oplysninger, der kopierer inde i andre levende ting—der findes i havene. Forskere satte sig for at undersøge marine viral fællesskabet, dets mangfoldighed, og dens funktion, især hvordan det påvirker mikrober. På torsdag, at de annoncerede oprettelsen af et enormt, globalt katalog af marine virus, der markerer et vigtigt skridt i at besvare mange af disse spørgsmål.
“Det udvider vores viden om, hvad den biologiske enheder på vores planet,” Ann Gregory, undersøgelse forfatter og postdoc på VIB-KU Leuven i Belgien, fortalte Gizmodo.
De data, der kommer fra 146 prøver taget på flere ekspeditioner ombord på skonnerten Tara, herunder 41 prøver fra 2013 en tur til det Arktiske Ocean. Forskerne først er nødvendige for at identificere, om det genetiske materiale i prøven var viral eller ikke, med forskellige bioinformatic værktøjer sammenligne det med kendte vira, forklarede undersøgelse co-forfatter Ahmed Zayed, ph.d. – studerende ved Ohio State University. Derefter, de sammenligner DNA-strenge til en anden for at dele dem ind i viral befolkninger.
Analysen afslørede 195,728 populationer af virus, 12 gange mere end den foregående analyse på et mindre Tara datasæt, ifølge den rapport, der blev offentliggjort i Cellen. Et nærmere kig afslørede, at disse befolkninger synes at sortere i fem meta-fællesskaber, som forskerne kalder økologiske zoner: Arktis, Antarktis, dybere end 2.000 meter; 150 til 1.000 meter, og tempererede/tropiske farvande, med dybder fra 0 til 150 meter. Måske overraskende, breddegrad ikke forudsige, viral mangfoldighed.
Det er et spændende stykke arbejde. Mikrober er måske den vigtigste drivkræfter i havet biokemiske processer, og mikrober er inficeret af virus. “Jeg tror, at folk er klar over, at viral mangfoldighed langt overstiger langt de mikrobielle diversitet,” Alison Buchan, professor ved University of Tennessee, Knoxville, fortalte Gizmodo. “Men der har ikke været et stort antal undersøgelser, der har forsøgt at kvantificere omfanget af denne mangfoldighed.”
Hvad gør du med så stort et datasæt? Hovedsagelig, du forskning for at forsøge at bedre at forstå de roller, alle disse vira. Ligesom hvordan den rabies virus kan øge aggression af et smittet dyr, for at lette overførsel, måske er der nogle af disse vira er vigtigt for havets kemiske processer. Mange af dem kan også føre til døden af mikrober. Og måske er dette enorme nye butik af den genetiske information indeholder noget, der vil være nyttige for mennesker.
“Måske du kan udvinde for det nye gener,” Gregory sagde. Kan forskere vil opdage nye antibiotika ved hjælp af denne genetiske information.
Dette datasæt er bestemt ikke udtømmende, Gregory og Zayed advaret. Det omfatter kun virus, der indeholder DNA, snarere end dem, der indeholder RNA (noget simpelt, DNA er sammensat af et par af de gratis dele af genetisk materiale, mens RNA består af en enkelt streng). Buchan også bemærkes, at det er mere et øjebliksbillede i gang. Seks måneder senere, kunne de have indsamlet forskellige resultater, sagde hun.
Denne forskning er en fantastisk påmindelse om, at så meget, som vi kender livet på Jorden, havene stadig er fuld af ubekendte.
Dele Denne Historie